המטרה הראשונית וסיבת הקיום של התוכנית הינה הגנה בפני רעידת אדמה צפויה. דא עקא שהסיכון העיקרי של סכנת רעידת האדמה מצוייה בסביבות השבר הסורי אפריקאי. דהיינו, האיום העיקרי היינו על הערים בסביבת השבר כמו: טבריה, צפת ובית שאן. אלא שמהבחינה הכלכלית לא משתלם ליזמים להכנס באזורים אלה לתוכנית. שווי הקרקע היינו קרוב לאפס ולכן הזכויות הניתנות מכוח תוכנית תמ"א אין בהם כדי הערך הכלכלי ששווה בשבילו להשקיע בחיזוק היסודות והקשחת הדפנות הדרושות לעמידה בפני רעידות אדמה. מכאן, שלמעשה לא פתרה התוכנית את הבעייה של עמידה בפני איום רעידת האדמה. תוך כדי תנועה ושיפור תנאי התוכנית התברר שלפחות באיזור המרכז התוכנית מעודדת שיפור באמצעי המיגון האזרחי, היות שעד לא הייתה חובת הקמת ממ"ד בדירות.